Sekolah Menengah Atas Katolik Swasta St Fransiskus Xaverius Harneno akhirnya dinyatakan sah sebagai salah satu lembaga mandiri dengan mengatongi Ijin Operasional Sekolah tanggal 14 April 2023 dan NPSN 4 Oktober 2024 dalam kunjungan Bunda Korwas SMA/SMK TTU pada hari Jumat (20/102023).
Pada kesempatan ini, Ketua Yayasan Pendidikan Kasih Setia Timor, Wilhelmus Nabu, SE mengucapkan terima kasih kepada berbagai pihak yang telah mendukung berdirinya SMAK ini.
"Terima kasih kepada Kepala Dinas Pendidikan Propinsi NTT, Bapak Linus Lusi, Ibu Lilis, Pak Leksi, Pak Yanto, Linda bersama tim. Terima kasih kepada Bunda Korwas TTU, Bupati dan Wakil Bupati TTU atas rekomendasinya, Camat Biboki Anleu, Kepala Desa Motadik, Kepsek SMAN Biboki Anleu dan tim, Kepsek SMP Nonotbatan.
Selain itu, beliau juga mengucapkan, "Terima kasih berlimpah kepada Yang Mulia Uskup Keuskupan Atambua atas Rekomendasinya, Romo Deken Pantura atas dukungan, Rm Maxi Amnanu sebagai mantan Pastor Paroki Fautoni, Rm F.X Naikofi pastor paroki Fautoni atas pendampingannya. Kepada para suster di Nonotbatan atas kesediaan pendampingan, kepada pemangku adat Raja Harneno, Usi Yoseph Harneno Tuan yang punya inisiatif menghadirkan lembaga ini, memberi ruang berupa lahan sekolah seluas ± 5 h.a untuk kemajuan pendidikan masyarakat adat Harneno. Terima kasih banyak Ketua Panitia Pembangunan, Ketua Komite, orang tua siswa, Kepsek dan Dewan Guru, seluruh masyarakat Biboki Anleu, para donatur Dedy Taolin, Agustinus Tulasi dan semua pendonor yang mempunyai inisiatif menghadirkan lembaga ini."
Lebih lanjut, Ketua Yayasan mengatakan, "Terima kasih kepada Ketua Komite, Ketua Panitia Pembangunan, Ketua koordinator lapangan, Kepsek dan Dewan Guru, siswa dan orang tua siswa, seluruh masyarakat Biboki Anleu khususnya Desa Motadik yang sudah memberi banyak bantuan melalui semangat gotong royong pembangunan fisik gedung darurat. Semoga kita selalu bersama dalam kebersamaan perjuangan menata dan meningkatkan pendidikan di wilayah ini."